驅動蛋白是1985年從魷魚的軸質中分離的一種發動機蛋白。用低角度旋轉投影電子顯示技術觀察結果顯示，驅動蛋白是一條長80nm的桿狀結構，頭部一端有兩個成球狀的馬達結構域，另一端是重鏈和輕鏈組成的扇形尾端，中間是重鏈組成的桿狀區。球狀的頭部具有ATP結合部位和微管結合部位。能利用ATP水解所釋放的能量驅動自身及所攜帶的貨物分子沿微管運動的一類馬達蛋白，與細胞內物質運輸有關。體外實驗證明驅動蛋白的運輸具有方向性，從微管的負極移向微管的正極，是正端走向的微管發動機。也有少數驅動蛋白的馬達結構域位于重鏈的C段，這類驅動蛋白的運動方向與前兩類的相反，是從微管的正極向負極移動。
動力蛋白和馬達蛋白的區別是什么?
動力蛋白，驅動蛋白和肌球蛋白同屬于馬達蛋白(或稱分子馬達)。各型肌球蛋白在微絲上運動，而驅動蛋白和動力蛋白在微管上運動。動力蛋白和驅動蛋白在分子起源上是沒有同源性的。關于染色體的遷移，動力蛋白和驅動蛋白都有參與(以下統稱為馬達蛋白)，過程復雜。在細胞分裂后期，馬達蛋白攜帶染色體，在ATP水解供能的情況下，向極端移動，同時微管隨之解聚變短;另外沒有連接有染色體的微管從兩極反向裝配而來，相互重合，通過一種雙極馬達蛋白，一頭在一條微管上運動，另一頭在另一條微管上運動，推動細胞兩極相向運動。
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